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El problema es que por lo visto Matlab entra en conflicto con el klipper, de manera que para que no se me olvide desactivar el klipper cada vez que ejecute Matlab voy a auntomatizarlo de la siguiente manera:
mv /usr/local/bin/matlab /usr/local/bin/matlab.bak
#!/bin/bash
PID=`ps x | grep klipper | head -n 1 | grep -o '[[:digit:]]\+' | head -n 1`
if [ "`ps $PID | grep -o 'klipper'`" == "klipper" ]; then
echo "Matando klipper..."
kill $PID
fi
matlab.bak
chmod ugo+x /usr/local/bin/matlab